Urząd Skarbowy prowadzi następujące ewidencje:
- Ewidencja podatników i płatników;
- Ewidencja zobowiązanych;
- Rejestr podatników podatku od towarów i usług;
- Rejestr wydanych zaświadczeń;
- Rejestr czynności cywilnoprawnych;
- Rejestry prowadzonych i załatwionych spraw;
- Rejestr aktów notarialnych;
- Rejestr zaewidencjonowanych kas fiskalnych;
- Rejestr kontroli podatkowych;
- Ewidencja mandatów;
- Ewidencja materiałów archiwalnych,
- Rejestr podatników podatku akcyzowego,
- Rejestr zużywających podmiotów olejowych i pośredniczących podmiotów olejowych.
Podstawę oraz zasady prowadzenia przez Urząd Skarbowy rejestrów, ewidencji i archiwów regulują następujące przepisy:
- ustawa z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa(tekst jednolity: Dz. U. z 2019 r., poz. 900 ze zmianami);
- ustawa z dnia 13 października 1995 r. o zasadach ewidencji i identyfikacji podatników i płatników (tekst jednolity: Dz. U. z 2020 r., poz. 170);
- Zarządzenie Ministra Rozwoju i Finansów z dnia 28 lutego 2017 r. w sprawie wprowadzenia instrukcji kancelaryjnej izb administracji skarbowej, urzędów skarbowych i urzędów celno-skarbowych oraz instrukcji w sprawie organizacji i zakresu działania archiwum zakładowego izb administracji skarbowej;
- Zarządzenie Ministra Rozwoju i Finansów z dnia 28 lutego 2017 r. w sprawie wprowadzenia jednolitego rzeczowego wykazu akt w izbach administracji skarbowej, urzędach skarbowych i urzędach celno-skarbowych;
- zarządzenie Nr 37/2012 Ministra Finansów z dnia 14 sierpnia 2012 r. w sprawie postępowania w przypadku zaskarżenia do sądu administracyjnego decyzji, postanowienia lub innego aktu albo czynności z zakresu administracji publicznej oraz rejestrów prowadzonych w tych sprawach ze zmianami;
- ustawa z dnia 29 września 1994 r. o rachunkowości (tekst jednolity: Dz. U. z 2019 r., poz. 351 ze zmianami);
- ustawa z dnia 5 sierpnia 2010 r. o ochronie informacji niejawnych (tekst jednolity: Dz. U. z 2019 r., poz. 742);
- ustawa z dnia 6 grudnia 2008 r. o podatku akcyzowym (t.j. Dz. U. z 2020 r. poz. 720)
ustawa z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (t.j. Dz. U. z 2020 r. poz.106 z późn. zm.) - regulamin organizacyjny urzędu skarbowego.